《最后一槍》以在國民政府實(shí)行“攘外必先安內(nèi)”政策的背景下，中統(tǒng)下令抓捕一名在洪城隱藏極深、身手厲害的中共潛伏特工“獨(dú)狼”的精彩故事展開，雙方斗智斗 勇，步步緊逼，最終由劉鈞飾演的代號“獨(dú)狼”的陳家二公子陳惠為保全弟弟不慎暴露身份遇害，其三弟陳澤(由保劍鋒飾演)繼承了二哥未完成的革命信仰，自此 踏上了與身為中統(tǒng)高層忠于國民政府的大哥陳恩以及出賣哥哥的叛徒斗爭的道路。全劇以懸疑元素貫穿，一個個隱藏極深的偽裝，一重重精心布局的陰謀，都將被主 人翁那最后一槍所瓦解。

　　三十年代末期的浙東水鄉(xiāng)，施家大院的新房里，被后媽林德賢強(qiáng)嫁給施傻子的王美云，可憐而無助。不諳男女之事的施傻子對王美云施虐。躲在房外聽動靜的表哥林國一，不顧一切闖進(jìn)門，救出美云出虎口。雨夜中，國一把美云藏于曠野涵洞下，自己引走了眾多來追趕的施家人。病入膏肓的大老爺林宗懿，發(fā)覺晚輩中少了美云，遂責(zé)怪大女兒德賢，一心把美云嫁出去就是為了侵吞美云親爹留下的財(cái)產(chǎn)。醫(yī)生對全家人說，林老爺恐怕熬不過今晚。老二林德軒從上海趕回家。他向家人宣講著抗日的道理。施家眾人闖進(jìn)林宅要人，德軒等人與之相持不下時，日本兵攻占了鎮(zhèn)海。生命即將衰竭的林老爺，做主定下國一和定云的姑舅親事。定玉暗自竊喜，國一卻感突兀。對著從抗日戰(zhàn)場趕回來的二兒子德軒，林老爺悄悄的告述他關(guān)于家產(chǎn)的秘密。
　　趙俊明帶著舞女翠仙從上?；貋怼５仑?、定玉母女難免心生怨恨。林老太太借故虐待丫頭桂菊，俊明打抱不平，林老太太則反唇相譏，意指他沒資格對自己說三道四。俊明要定玉退掉和國一的婚事，重進(jìn)學(xué)堂做個知識女性，去尋求個性解放。國一、美云好心勸慰定玉不要為父親俊明的所為過于傷心。定玉恨透了包括美云和父親在內(nèi)的家里所有的人，國一則不理解定玉為何變得如此刁蠻。美云向定玉述說著自己內(nèi)心的凄苦，定玉聽了有些心動?？∶魍低底冑u德貞的首飾，換了現(xiàn)錢領(lǐng)著翠仙到寧波城玩樂。德軒戀人王淑如在傳送抗日情報(bào)時，被關(guān)校長盯梢。德軒槍逼關(guān)校長借錢用以抗日，并要他寫下借據(jù)，留下“資助抗日”的證據(jù)。等待這些年輕人和他們的長輩的命運(yùn)，到底是什么呢。

崔世心有慘痛的童年記憶，9歲時因她貪圖玩耍導(dǎo)致4歲的妹妹崔夢蕾被拐。為找妹妹，她確定了當(dāng)警察打拐的人生目標(biāo)。20年近乎絕望的找尋，讓崔世心一家異常煎熬，她和醫(yī)生婁群的戀情也苦楚壓抑。神秘女孩華蘿闖進(jìn)了他們的生活，崔世心發(fā)現(xiàn)這女孩跟人販有聯(lián)系。崔世心為丟失兒童忙碌著。傳奇人販“鬼爺”正活躍在這個城市，狡猾人販蔡小龍是“鬼爺”鄧廣天的養(yǎng)子，亦是“妹妹”華蘿的青梅竹馬。一向雷厲風(fēng)行的崔世心此時內(nèi)外交困、腹背受敵，不顧父母反對，對華蘿進(jìn)行徹查調(diào)底。在抓捕華蘿時，發(fā)現(xiàn)華蘿就是妹妹崔夢蕾。崔世心把華蘿接回家，發(fā)現(xiàn)妹妹沒有想象的那樣清白。華蘿身上隱藏著一個秘密，只有秘密破解，才能將“鬼爺”的拐賣團(tuán)伙粉碎，崔世心通過努力，終于讓華蘿迷途知返。

　　1927年，白色恐怖籠罩中國。
　　中共地下黨夏風(fēng)和朱雷在咖啡廳秘密接頭時，遭到國民黨特工高揚(yáng)伏擊。朱雷十二歲的女兒朱美云，親眼看見父親死在自己面前。夏風(fēng)重傷被俘，他的未婚妻、進(jìn)步學(xué)生陸玫，強(qiáng)忍悲痛，帶著朱美云匆匆逃離。
　　十年后，上海淪為孤島。已是中共炸彈專家的陸玫與組織失去聯(lián)系，流落上海。成長為狙擊手的朱美云一心為父報(bào)仇也返回了上海。兩人與仇人高揚(yáng)不期而遇。民族大義下，他們求同存異。愛國護(hù)士孟香蘭，青幫闊少趙非以及保鏢葉三，女游擊隊(duì)員鐵妞等先后加入，一支獨(dú)特的敵后抗日小隊(duì)就此成立。
　　梅機(jī)關(guān)副機(jī)關(guān)長渡邊，秘密醞釀南北漢奸合流的陰謀。于此同時，軍統(tǒng)與76號之間也正進(jìn)行著一場殘酷的較量。這是一場同學(xué)、朋友之間的殺戮。本著共同抗日的原則。陸玫帶領(lǐng)小隊(duì)協(xié)助高揚(yáng)，懲治一批罪大惡極漢奸。同時，自己也付出了慘痛代價(jià)。軍統(tǒng)上海站被端，中共聯(lián)絡(luò)員老馬犧牲。最后，陸玫用計(jì)，誘使渡邊上當(dāng)，除掉了漢奸王貌霖。渡邊南北合流的計(jì)劃被迫流產(chǎn)。
　　陸玫費(fèi)勁周折，終于與組織上取得了聯(lián)系。結(jié)合小隊(duì)的自身特點(diǎn)，組織上決定由陸玫領(lǐng)導(dǎo)小隊(duì)繼續(xù)在敵后執(zhí)行抗日任務(wù)。
　　渡邊獲悉，國民政府正秘密向南轉(zhuǎn)移一批故宮國寶。他對這批國寶虎視眈眈，立刻派76號主任王群追查線索。因軍統(tǒng)上海站嚴(yán)重破壞，高揚(yáng)迫不得已向陸玫求助。得到上級指示后，陸玫率領(lǐng)小隊(duì)全力協(xié)助高揚(yáng)。他們在當(dāng)?shù)赜螕絷?duì)的配合下，成功阻擊了渡邊。搶在他之前將線索傳遞了出去。渡邊的計(jì)劃再次失敗。
　　日本隨軍記者武藏，因親眼目睹了南京大屠殺的慘狀，精神受到極大刺激。他攜帶記錄有日軍暴行的照片悄悄逃走。日軍為毀滅證據(jù)，派出精銳特遣隊(duì)一路追殺。陸玫奉命摔小隊(duì)護(hù)送武藏向重慶轉(zhuǎn)移。護(hù)送途中，小隊(duì)誤入日軍秘密基地。他們親眼目睹被軍國主義洗腦的少年，親手殺死自己的養(yǎng)父母。隊(duì)員們受到極大震撼。武藏也開始重新審視這場戰(zhàn)爭。幾番較量后。日軍特遣隊(duì)被消滅。南京大屠殺資料被安全送到重慶，日軍暴行被公布于眾。
　　在地下黨的協(xié)助下，陸玫率領(lǐng)小隊(duì)為新四軍戰(zhàn)地醫(yī)院購得一批緊缺藥品。渡邊派出間諜梅子協(xié)助佐田，妄圖追蹤小隊(duì)，順藤摸瓜，挖出我戰(zhàn)地醫(yī)院。陸玫識破渡邊的陰謀后將計(jì)就計(jì)，故意放出假情報(bào)，誘使佐田進(jìn)入事先設(shè)好的包圍圈。佐田僥幸逃脫，間諜梅子卻被朱美云一槍擊斃。藥品被順利送到醫(yī)院，傷員們得到了救治。
　　渡邊通過線索，發(fā)現(xiàn)了新四軍剛剛建成的兵工廠，軍工專家孫教授被佐田狙殺。為挽救我黨剛剛誕生的軍事工業(yè)，陸玫接到組織上下達(dá)的命令，帶領(lǐng)小隊(duì)返回上海，迎接從德國學(xué)成歸來的槍械專家。渡邊獲悉情況，派佐田對槍械專家展開追殺。陸玫制定計(jì)劃，安排高揚(yáng)制造混亂，趁亂將槍械師接走。佐田一路尾隨，卻被朱美云巧妙狙殺。槍械師被安全送往根據(jù)地，兵工廠重新運(yùn)轉(zhuǎn)起來。
　　痛失左膀右臂的渡邊將小野、秋子調(diào)到身邊。
　　渡邊截獲了一只重要的密碼箱。為完整無損的得到里邊的文件，他派小野潛入提籃橋監(jiān)獄，協(xié)助被關(guān)押的密碼專家史密斯越獄。高揚(yáng)隨即也潛入監(jiān)獄，試圖阻止小野。卻不想史密斯竟獨(dú)自越獄。我黨獲悉這一情報(bào)后，派陸玫率領(lǐng)小隊(duì)協(xié)助高揚(yáng)奪回密碼箱內(nèi)的文件。在陸玫的巧妙安排下，小隊(duì)將密碼箱和史密斯掉包。密碼箱被成功打開，高揚(yáng)將文件安全送到了重慶。小隊(duì)也圓滿完成了任務(wù)。
　　一筆愛國華僑的援助捐款存在瑞士銀行，但只有租界外董弗蘭克才能取出這筆錢。為此，高揚(yáng)率領(lǐng)軍統(tǒng)行動隊(duì)奔襲蘇州集中營。高揚(yáng)雖然將弗蘭克救出，但行動隊(duì)卻幾乎全軍覆沒。陸玫接到組織命令，全力協(xié)助軍統(tǒng)方面轉(zhuǎn)移弗蘭克。此次行動由軍統(tǒng)代號為“師父”的指揮官負(fù)責(zé)。但在“師父”的計(jì)劃中，這支共產(chǎn)黨小隊(duì)扮演著炮灰的角色。高揚(yáng)獲悉后，毅然回到陸玫等人身邊，他要與曾經(jīng)并肩作戰(zhàn)過的小隊(duì)成員同生共死。小隊(duì)遭遇日軍埋伏，朱美云犧牲。趙非和葉三用自己的生命作誘餌，將渡邊引開。在掩護(hù)撤離過程中，鐵妞也壯烈犧牲。最終，弗蘭克雖然被安全送走，但小隊(duì)卻付出了慘重的代價(jià)。
　　日本戰(zhàn)敗投降。試圖蒙混過關(guān)逃避審判的渡邊被陸玫識破，兩人決斗。危機(jī)時刻，失蹤多年的夏風(fēng)突然出現(xiàn)，將渡邊擊斃。戀人重逢，陸玫卻發(fā)現(xiàn)夏風(fēng)身上有諸多的疑點(diǎn)。
　　于是，陸玫暗自調(diào)查。當(dāng)年的一幕漸漸清晰：朱雷得知夏風(fēng)是隱藏在我黨內(nèi)部的臥底，于是決定鋤奸。同時，夏風(fēng)也感覺到自己暴露，遂命令高揚(yáng)在咖啡館埋伏。
　　陸玫和夏風(fēng)這對情人為了信仰反目。危機(jī)關(guān)頭，高揚(yáng)出現(xiàn)，與陸玫聯(lián)手將“師父”夏風(fēng)除掉。回首往事，高揚(yáng)發(fā)現(xiàn)自己的信仰已經(jīng)發(fā)生了改變，在陸玫的影響下，他從此走上了革命的道路。

元天晴結(jié)婚前夕遭遇未婚夫去世，又被繼父陸大志趕出家門，身無分文的她搭上了一對新婚夫妻杜宇凱和李雨晴的車，陰差陽錯的戴上了李雨晴的結(jié)婚戒指，此時發(fā)生車禍。元天晴活了下來，卻因?yàn)檫@枚戒指被誤認(rèn)為杜家媳婦，肚里的孩子也被當(dāng)成了杜家孫子，為了順利生下孩子，元天晴冒著別人的身份在杜家留了下來，卻跟杜宇凱的弟弟杜宇航開始了一段刻骨銘心的感情，這引起了宇航的繼母錢玉容的不滿，她用各種辦法拆散他們，撮合侄女和宇航在一起。錢玉容無意中認(rèn)識了陸大志，由此揭開了元天晴的身份之謎，元天晴和杜宇航被錢玉容趕出杜家。為了獨(dú)吞杜家財(cái)產(chǎn)，錢玉容更是和陸大志一起氣死了丈夫杜博民，玉容卻被陸大志出賣人財(cái)兩空，絕望之時她幡然醒悟，真誠地向元天晴和杜宇航道歉。杜宇航和元天晴終于走到了一起，放下仇恨，原諒了錢玉容,一家人和睦相處。