1997年2月から1998年1月までテレビ放送された、リメイクヴァージョン。『美少女戦士セーラームーン セーラースターズ』の後継番組として製作さた。
　　本作におけるハニーはアンドロイドでは無く空中元素固定裝置によって生み出された人造生命であり、最終回では青児との間に生まれた娘が登場している。また、ライバルとしてもう一人のハニー『ミスティーハニー』が登場している。
　　この作品では永井豪は「原著作」である。その上で、実質(zhì)の原作者?飯坂友佳子が少女漫畫に翻案した形で企畫當(dāng)初より參加?コミカライズした。
　　番組終盤にハニーをサポートする女性科學(xué)者役として初代ハニー役?増山江威子がゲスト出演している。
　　第1作と比べかなり少女アニメらしい作品になった。これは枠として『セーラームーン』の視聴者層にそのまま見続けてもらうために制作されたためである?！亥濠`ティーハニー』の原作や第1作のようなギャグ?お色気要素が少ない。あわせてオリジナルシリーズにはなかった戀愛、近親憎悪、三角関係、結(jié)婚、出産などの女性視聴者を意識した要素が加えられた。
　　バンダイのアンケートによると、1997年の「好きなキャラクター」で3歳～5歳女児と6歳～8歳女児の2部門で本作が1位を獲得している。
　　10月以降は土曜18:30から（ただし関西地區(qū)は放送時間繰上げ）に変更になったが、およそ一年で終了、次番組『アニメ週刊DX!みいファぷー』に交代した。
　　朝日放送では放送時間移動を機(jī)に提供表示がブルーバックに変更されるとともに、提供クレジット時のBGMも廃止された。

　　一天，工藤大器偶然聽到了神秘聲音的呼喚，與朋友們一起來到了數(shù)碼世界，在那里認(rèn)識了眾多的數(shù)碼獸同伴并且成為指揮官建立“Xros Heart”團(tuán)隊。意想不到的是，在數(shù)碼世界中除了他們外竟然還有別的人類在數(shù)碼世界中活躍著……然而，為了防止邪惡的巴古拉軍企圖稱霸數(shù)碼世界，他們將要努力地收集水晶（Code Crown）來保護(hù)各個領(lǐng)域（Zone），擔(dān)負(fù)起拯救數(shù)碼世界的命運。
　　被巴古拉獸擊回到人類世界的工藤大器和高吼獸，經(jīng)過東京大決戰(zhàn)留在人類世界一天后，相對地數(shù)碼世界已經(jīng)過了好幾個月的時間，并落入了巴古拉軍支配下的地獄世界，分裂為七個國家（Land），由七名巴古拉軍手下的死亡指揮官所統(tǒng)治，而這七名死亡指揮官就是本篇章的主要敵人。為了讓數(shù)碼世界再次得到和平，工藤大器和高吼獸決定再次回到危機(jī)四伏的數(shù)碼世界中。此外，本篇章亦出現(xiàn)全新力量“超進(jìn)化”。
　　與巴古拉獸的最終決戰(zhàn)已經(jīng)過去了一年，天野音音的弟弟-天野悠入讀大器所讀的中學(xué)，并與大器組成“Xros Heart”的籃球隊，過著悠閑的生活，而隊伍中還有一名尊敬著大器學(xué)長的成員-明石激。一天，明石激被卷入了“數(shù)碼晶界”所發(fā)生的異變之中。

大門大意外地遇到了亞古獸，兩人見面就大打出手，亞古獸戰(zhàn)敗后稱大門大 為大哥，但是數(shù)碼特搜部隊（DATS）不容許未受其隊員管理的數(shù)碼獸留存在這個世界上，必需送回數(shù)碼世界，而后湯島告訴大若加入DATS他就可以跟數(shù)碼世界的強(qiáng)敵戰(zhàn)斗，大因此加入DATS，與淑乃及托瑪組成小組，一同解決數(shù)碼事件。托瑪發(fā)現(xiàn)日本的數(shù)碼事件頻率增加并非偶然，因此請假回到歐洲調(diào)查，發(fā)現(xiàn)根源來自于人類的七宗罪。而比丘獸的事情讓大他們知道了其幕后黑手是究極體數(shù)碼獸——墨丘利獸搞的鬼，也因此決定動身前往數(shù)碼世界。而在數(shù)碼世界，他們見到了一個人類小孩——郁人，他自稱數(shù)碼獸，對人類懷有怨恨。

　　2002年，數(shù)碼世界面臨滅亡的危機(jī)！數(shù)碼世界本是由究極天使獸、基路比獸及神圣天女獸三大天使所管治的，然而其中一位天使——基路比獸卻叛變，這使得數(shù)碼世界的平衡受到破壞，并開始崩潰……
　　古代曾經(jīng)拯救數(shù)碼暴龍世界的十斗士現(xiàn)在已不存在。就在這危急關(guān)頭，十斗士的斗士精神把新力量給予了另一個世界——現(xiàn)實世界的孩子……
　　主角拓也等人，將進(jìn)入數(shù)碼世界，變身成數(shù)碼暴龍，投入這場冒險與戰(zhàn)斗的旅程！