這是五十年后的未來，世界被“神”吞噬殆盡而荒蕪的架空故事。 由于遭到突如其來的怪物“荒神”的破壞而失去平衡。在人類文明既有的兵器都因荒神的“捕食”本能而無效化下，生化科技企業(yè)“芬里爾”成功利用荒神細胞開發(fā)出了名為“神機”的生物兵器。并同時組織了特殊部隊“GOD EATER”。自此，人類終于獲得了與荒神對抗的力量。

　　立花螢（小松未可子 配音）是一位擁有著強烈正義感的少女。某日，她搬入了月城莊公寓，準備開始一個人的生活。讓住在202室的螢沒有想到的是，自己隔壁竟然住了一個名叫松崗正宗（前野智昭 配音）的牛郎，這個舉止輕浮油腔滑調(diào)的男人沒有給螢留下什么好印象。
　　矢島鼎（堀江由衣 配音） 是螢唯一的朋友，某日，鼎告訴螢，自己被一個牛郎騙光了所有的積蓄，這讓螢憤憤不平。螢沖到了牛郎店想要找到欺騙鼎的那個牛郎，為好友討回公道，然而，令螢震驚的是，這個牛郎不是別人，正是自己的鄰居松崗。而面對螢的挑釁，松崗竟然提出要用槍來一決勝負，就這樣，螢被卷入了一個你爭我斗的生存游戲之中。

　　サマーフェスから1か月が過ぎた頃、346グループ會長の娘で、米國の関連企業(yè)から戻ったばかりの美城常務(wù)がアイドル部門の統(tǒng)括重役として赴任する。成果が上がるまでの時間がかかりすぎている346プロの現(xiàn)狀を問題視する常務(wù)は、全プロジェクトを解體して白紙に戻し、有望なアイドルを見定めて彼女らを中心に據(jù)える346ブランドの強化案を?qū)g行に移した。フェス後に順調(diào)に仕事を増やしてきたCPも影響を受け、プロジェクトルームも30階のオフィスから地階へと移ることになる。畫一化されたアイドルの理想像を提唱する常務(wù)に対し、アイドル各人の個性の成長を重視するプロデューサーは対案として「シンデレラの舞踏會」企畫を提示し、今期末（冬）までに一定の成果を出すことを條件に自由裁量権を得る。
　　強引な改革は346プロを徐々に変えていく。常務(wù)が有力なアイドルへの働きかけを続ける裏で、CPは「舞踏會」の為に更なるスキルアップに勵み、その過程で常務(wù)の路線に難色を示す他部署のアイドルをも巻き込んでいく。やがて常務(wù)は自ら選抜したアイドル達で構(gòu)成される新企畫「Project:Krone」を発表するが、そのメンバー候補の中にはアナスタシアと凜も含まれていた。アナスタシアは自身の成長のためにあえて參加を決意し、その意を受けた美波と、CPの枠を越えてアイドル各人の將來を考え始めたプロデューサーの承認を受けて「LOVE LAIKA」との掛け持ち態(tài)勢に移る。一方、同じく「Krone」に選ばれた中學(xué)校時代の同級生?北條加蓮と、その相棒?神谷奈緒とのユニット「トライアドプリムス」に惹かれる「なにか」を感じた凜は卯月と未央に相談を持ちかける。未央は一度は「Krone」への參加に反発するが、凜が求めている「なにか」を自分なりに確かめるため、自分もソロ活動に挑戦することを宣言し、凜の背中を押す。
　　常務(wù)から各部署の査定會を兼ねるオータムフェスに急遽參加を求められたプロデューサーは、他部署からの応援を加えてCPを再編成する。