柯南、灰原及少年偵探隊(duì)成員步美、光彥、元太隨博士這日露營完畢，繞道參觀西多摩市新建于富士山前的日本第一雙塔摩天大樓，毛利小五郎恰也應(yīng)雙塔所有者、他的學(xué)妹常盤美緒之邀，攜小蘭、園子參加開幕典禮。美緒介紹下，他們認(rèn)識以畫富士山聞名的畫師如月峰水、市議員大木巖松、雙塔的設(shè)計(jì)者風(fēng)間英彥（森谷帝二的弟子，第一彈《引爆摩天樓》中，森谷曾向新一挑戰(zhàn)）、天才程序員原。期間灰原的舉動異常。

間諜加布利爾（約翰?特拉沃塔 John Travolta）在多年特工生涯中，獲知政府多年非法收斂了一筆公款。而加布利爾若想實(shí)現(xiàn)自己心中的夢想，錢是最關(guān)鍵的因素。正因如此，機(jī)智狡猾的加布利爾決定向這筆贓款下手。要想計(jì)劃能順利進(jìn)行，加布利爾需要一名頂尖的電腦黑客。斯坦利（休?杰克曼 Hugh Jackman）正是地球上最頂級的黑客之一，多年前他就把FBI引以為豪的安全系統(tǒng)搞得天翻地覆，亦因此的引來牢獄之災(zāi)，妻子帶著女兒遠(yuǎn)走他鄉(xiāng)。出獄后一直被禁止使用電腦和其他電子產(chǎn)品。 加布利爾派他的女搭檔金吉爾（哈莉?貝瑞 Halle Berry）游說斯坦利出山，承諾成功后幫斯坦利取回女兒的撫養(yǎng)權(quán)并安排其遠(yuǎn)走高飛享受新生活。經(jīng)不住誘惑，斯坦利再度出山。然而，事情并沒有像預(yù)想中順利……