自2002年X檔案的六年后，前聯(lián)邦探員丹娜·斯科莉（吉蓮·安德森 Gillian Anderson 飾）調(diào)任某教會(huì)醫(yī)院擔(dān)任醫(yī)師，?？怂埂つ碌拢ù笮l(wèi)·杜楚尼 David Duchovny 飾）則過著隱居的生活，繼續(xù)著對超自然現(xiàn)象的關(guān)注。某天，F(xiàn)BI探員前來請求他們的幫助。原來一段時(shí)間內(nèi)，維吉尼亞州接連有數(shù)名女子神秘失蹤，其中甚至包括一名聯(lián)邦探員。由于神父約瑟夫（Billy Connolly 飾）聲稱看到了犯罪畫面，因此FBI希望對超自然案件有著豐富經(jīng)驗(yàn)的穆德和斯科莉協(xié)助調(diào)查。然而隨著調(diào)查的深入，穆德和斯科莉卻發(fā)現(xiàn)案件的黑暗遠(yuǎn)遠(yuǎn)超出他們的想象。這對合作多年的搭檔面臨著巨大的考驗(yàn)…… 　　本片為同名美劇的第二部劇場版。

宦官劉瑾禍國殃民，殘害忠良，他處死兵諫的安化王，又恐其孫朱鼎才告御狀；于是不斷派殺手，想斬草除根，回回鎩羽而歸。千戶長金獅靈機(jī)一動(dòng)，從東瀛請來五行忍者，再次展開誅殺行動(dòng)！最終仍邪不勝正。

明朝正德年間，安化王因兵諫武宗失敗遇害后，其孫朱鼎才懷揣他們所留下的血檄文，不惜冒險(xiǎn)前往京城，以‘舍身套狼’的妙計(jì)，順利鏟除劉瑾，被皇上御賜‘神勇小欽差’代己巡狩天下，查探民間的疾苦，為百姓伸張正義。

美麗優(yōu)雅的瑪雅·雷丁斯卡婭（索菲雅·斯凱亞 Sofya Skya 飾），儼然一個(gè)得到上蒼眷顧的女性，她曾是俄羅斯當(dāng)紅的芭蕾舞演員，聚光燈的榮耀延展到生活中，其丈夫是在俄國經(jīng)營煉油廠的美國人邁克爾·梅森（克里斯汀·史萊特 Christian Slater 飾），為人溫柔和善，他們的女兒妮娜（Marianna Khalifman 飾）美麗可愛，繼承了父母的所有優(yōu)點(diǎn)。但是世界就是這樣，永遠(yuǎn)沒有完美的人和事。邁克爾的風(fēng)光引來忌恨，他最終倒在黑幫的槍口之下。在此之后，厄運(yùn)如影隨形跟蹤這對從天上跌落低下的母女?，斞旁馐懿囟局缚?，鋃鐺入獄；避難美國的妮娜不久后也遭到綁架，下落不明。 　　命運(yùn)固然殘酷，但女兒則成為瑪雅生存下去的最大動(dòng)力，曾經(jīng)高雅圣潔的白天鵝，于泥潭腥臭之處振翅高飛……

國際安全局的王尚恩（安志杰 飾）率萬飛（周杰倫 飾）等部下遠(yuǎn)赴約旦，押送制造天花病毒變體的科學(xué)家肯納，豈料王尚恩叛變將肯納劫走，萬飛頭部受重傷，他同隊(duì)中的心上人也在這次任務(wù)中身亡。三個(gè)月后，王尚恩等人研制的病毒造成一艘貨船上的人們盡數(shù)死亡，而他此時(shí)準(zhǔn)備販賣疫苗謀取暴利；萬飛在醫(yī)院中被告知頭部的子彈無法取出，神經(jīng)受損導(dǎo)致他兩周后會(huì)有生命危險(xiǎn)，萬母向其透露他有一個(gè)失散多年的哥哥。為了完成母親心愿，萬飛前往吉隆坡尋找哥哥萬陽（謝霆鋒 飾）。飛機(jī)上與萬飛同行的簡博士恰巧是王尚恩一伙準(zhǔn)備用來替換肯納的病毒專家，簡博士被王尚恩派出的萬陽劫持，萬飛出手相救。因?yàn)榉謱俨煌嚑I，兄弟只得拳腳相見……

阿里是一位蘇格蘭場（指英國首都倫敦警務(wù)處總部）的警察，他出生于巴基斯坦的拉合爾，之后娶了一個(gè)英國女人，并育有兩個(gè)孩子。在2005年7月倫敦連環(huán)爆炸案發(fā)生后，阿里奉命去調(diào)查一個(gè)相關(guān)的嫌疑犯，工作進(jìn)展的很不順利，同時(shí)身為穆斯林的他，盡管已經(jīng)在蘇格蘭場工作多年，但是由于爆炸案，也受到了同事們異樣的注視。雖然最后事情水落石出，但是期間受到的歧視與人們對爆炸案的恐懼，還是讓他久久難以釋懷。

徐冰是酒店主廚。因單身性情冷漠，常被后廚一幫年輕小伙猜測和議論。但這并不影響徐冰在后廚、乃至整個(gè)酒店的地位和威望。可徐冰平靜的生活被一個(gè)朋友的兒子冬冬打亂了。 　　冬冬是徐冰情敵的兒子。冬冬媽不久前死于車禍，爸爸遠(yuǎn)在捷克，冬冬因流浪街頭被警察送來后，徐冰不得不管。這時(shí)，酒店經(jīng)理新請來一名廚師時(shí)慧寶。時(shí)慧寶特別喜歡孩子，沒幾天工夫就跟被徐冰帶到后廚的冬冬親如爺倆。帶冬冬一塊玩的日子里，徐冰分明感覺到時(shí)慧寶的愛情攻勢，徐冰塵封的愛情閘門似開似合。但徐冰因時(shí)慧寶跟后廚伙計(jì)的玩笑，憤而辭職。 　　其實(shí)結(jié)婚后，冬冬的媽媽一直覺得對不起徐冰，直到半年前查出肝癌晚期，冬冬媽堅(jiān)持要來看望徐冰，求得徐冰的原諒，結(jié)果在半路死于車禍。終于，在得意弟子素素結(jié)婚的那天晚上，走出愛情陰影的徐冰終于投入時(shí)慧寶的懷抱……